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2022年元旦後，臺灣出現首例新冠肺炎變異毒株OMICRON本土病例，社區陸續傳出疫情。時至3月下旬，全臺確診個案數逐日升高，由於變異毒株的傳播速度快、範圍廣，以致疫情持續擴大，5月達疫情最高峰。疫情第三年，慈濟依然在第一時間啟動關懷行動，為第一線防疫單位提供相關防疫物資需求，提升防疫能量，防疫紓困行動不停歇。
新北市啟動「居家照護計畫」，並成立居家照護關懷中心，協助輕症居家照護者或密切接觸者，處理因無法出門所產生的種種生活困難，及其他緊急事故。慈濟應新北市中和、八里、汐止區等區公所邀請，動員志工進駐居家照護關懷中心，透過專線電話關懷居家照護者、居家陽性者。疫情日趨嚴峻。5月新北市單日確診已突破萬人，居家照護人數也超過三萬人，於是大臺北地區志工投入支援，包含繕打資料、電話關懷等作業。
接獲花蓮縣秀林鄉鄉長王玫瑰提報，水源村受新冠肺炎疫情影響，居家隔離民眾需要生活物資支援。志工即時打包並將六百箱「安心生活箱」送抵水源村，守護村里鄉親健康。另，關心警消人員防疫期間健康安全，同步將送安心祝福禮、淨斯本草飲等，送達北埔派出所、消防局北埔分隊，感恩他們的辛勞。
防疫期間，36處慈濟靜思堂化為「疫苗施打站」，讓民眾可以安心、就近接種疫苗。2022年6月下旬起，臺中市政府再度借用慈濟中區六個園區進行疫苗施打作業。
花蓮黎明教養院在4月底發生院內感染，院生及工作人員陸續確診。慈濟緊急提供院方所需要的防疫物資，包含：快篩試劑、N95口罩、隔離衣、安心生活箱、靜思本草飲等，由院長邱淑義代表接受。院長邱淑義指出，感謝自疫情發生以來，受到各界的幫助，不論是防疫物資或是各種形式的關懷，都給予黎明教養院很大的援助。感謝慈濟的及時雨，讓他們面對疫情，也可以儘速回歸正常生活。
關懷行動：膚慰關懷、熱食提供、慰問金發放、醫院關懷、祝福禮發放、災後清掃、修繕與重建等
9月18日在東臺灣池上發生芮氏規模6.8的地震，也造成玉里、池上等地區傳出房舍倒塌或嚴重受損的災情。慈濟人在地震發生後，啟動緊急階段發放慰問關懷工作，發動志工協助校園環境復原。災後並啟動受災戶的房屋重建及修繕關懷工作，讓受災鄉親可以安心過年。
關懷行動：
9月18日地震當天，投入急難救助；玉里慈院啟動大量傷患機制
9月20日協助花蓮2校震後清理復原
9月25日花蓮玉里安心家訪475戶
9月27日與花蓮縣府簽訂災後復建合作備忘錄
9月28日招募全臺專業修繕志工
9月29日首批修繕志工會勘，並進行第一戶修繕工程
10月2日臺東7鄉鎮安心家訪324戶
10月5日與臺東縣府簽訂災後復原與重建合作備忘錄
10月6日展開學校修繕，進駐富里國小施工
10月16日臺東輕、中災戶修繕完成
11月6日第一階段修繕工程圓滿，舉辦茹素護生祈福會
12月12日為嚴重受災戶援建鋼構安心屋
2023年 1月17日首梯6戶鋼構安心屋交屋
2023年3月完成第7戶鋼構安心屋及4所學校修繕
鋼構安心屋
建材：鋼材骨架、金屬外層庫板牆面、矽酸鈣板隔間，含衛浴設備
施工法：預作建材現場組裝，搭配木工、水電施作
特色：防火、防震、隔熱、防潮，為正式住屋